1996年阜阳热电厂建成并投入运营，整个建设过程仅历时1年零2个月，为谋求更大的发展空间，公司将该厂80%的股权转让给英国国家电力公司，为公司的下一步发展准备了充足的资本金。

　　1997年，建成合肥国祯高新热电有限责任公司；开工新建亳州国祯热电有限责任公司三号机组；收购兼并亳州热电厂、淮北烈山煤矸石电厂，企业规模迅速扩张。

　　1998年，收购兼并安徽生物药厂，引进国家生物二类新药——母牛型分枝杆菌菌苗，在此基础上组建龙科马生物制药有限责任公司，使公司向着进军生物制药等高科技产业的目标又迈进了一大步。

　　1999年，公司联合合肥高新技术产业开发区科技实业发展公司等企业发起设立了安徽国祯环保节能科技股份有限公司。